Federico Lértora del Querétaro ha giocato la maggior parte delle gare della sua squadra in Liga MX nel 2023/2024, avendo collezionato 34 presenze, per un totale di 2892 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in tutte le 34 presenze, su 35 giornate.
La sua ultima presenza in Liga MX risale al 3 maggio, con la maglia del Querétaro contro il Club Necaxa. In quella gara ha segnato nonostante la sconfitta per 4-3. In totale il centrocampista ha segnato 4 gol in questa stagione - terzo a pari merito tra i giocatori del suo club; ha inoltre offerto 1 assist. Ha ricevuto 9 cartellini gialli.
Ha aperto le sue marcature nella stagione di Liga MX contro il Club Santos Laguna il 3 luglio, nella vittoria per 2-0.
Lértora ha giocato 30 partite di Liga MX nell'ultima stagione con il Tijuana, gare in cui ha segnato 2 gol.
Il centrocampista è passato a giocare in prestito con il Querétaro FC nel giugno 2023. In precedenza giocava per il Tijuana, per cui ha collezionato 30 presenze in campionato, con 2 gol, dopo aver raggiunto il club nel luglio 2022, mentre prima giocava per il Colón de Santa Fe.